复杂蛋白质样品的高效分离是提高MS对蛋白质鉴定覆盖度的重要因素。2D-Gel技术是依据蛋白质等电点（iso-electric point）和分子量的差异，通过等电聚焦（IEF）和SDS-PAGE的二维分离，不同性质的蛋白质以点状的形式（spot）分布在凝胶上；
样品通过2D-Gel分离后，每个点上的蛋白质复杂度急剧降低。因此，凝胶上的蛋白质酶解后，不需要再进行LC分离，可以直接进行MALDI-TOF MS分析，从而缩短实验周期和降低MS测试费用；
2D-Gel技术几乎兼容所以来源的蛋白质样品（细胞、组织、体液等）；
2D-Gel结合MALDI-TOF MS，主要用于差异蛋白质组分析。
技术路线：
实验流程：
1.蛋白质提取及定量；
2.蛋白质分别进行2D-Gel电泳及染色；
3.扫描图片，用软件对图像进行分析，寻找差异点；
4.切割差异点，Trypsin酶解，提取肽段，MALDI-TOF MS完成蛋白质鉴定；
5.数据筛选，挑选蛋白质进行验证（Western blot等）。
动物实验
