无论是体内组织还是体外细胞系，不同细胞之间都存在着差异性，即细胞的异质性。细胞的异质性对解释肿瘤的发生、干细胞或前体细胞的多能性与谱系分化、干细胞与微环境的相互作用等具有重要意义。近些年，单细胞测序技术迅速发展，使得研究细胞之间的异质性成为可能。然而，目前单细胞测序的方法均会丢失细胞在体内原有的位置信息，而对某些研究领域如发育生物学、肿瘤生物学而言，细胞来源的位置信息是十分关键的。

    在景乃禾和彭广敦的指导下，陈军通过整合与优化单细胞测序和激光显微切割技术，构建了一种能够获得少量细胞转录组信息，同时保留细胞原有位置信息的测序方法：Geo-seq。

    Geo-seq是一种高效、高分辨率的空间转录组分析方案，既可用于转录图谱的三维重建，也可用于研究具有特殊结构的少量组织或细胞的转录组信息。利用Geo-seq技术，该课题组绘制了小鼠早期胚胎原肠运动中期精细的三维分子图谱，并揭示了小鼠细胞谱系蓝图建立过程中的空间转录组特征、转录因子和信号通路调控网络。

    据悉，Geo-seq技术已成功应用于小鼠大脑发育、肝脏肿瘤学以及人的精子发育等研究中。